여권이 추진 중인 '중대범죄수사청' 설립의 핵심은 검찰이 갖고 있는 수사권과 기소권을 분리해 검찰 권력을 분산하자는 것이다.

검찰의 제 식구 감싸기라는 비판을 의식한 듯 윤 총장은 "검찰 조직의 반부패부를 싹 끌고가서 반부패수사청을, 서울남부지검을 싹 들고가서 금융수사청을, 공안부를 총장 관할 밖으로 들고 나가 안보수사청을 만들어 수사와 기소를 융합해 주요 범죄에 대한 국가적 대응역량을 키워야 한다"고도 말했다.

검찰총장의 힘을 빼더라도 중대범죄 수사를 위해 수사권과 기소권이 함께 가야 한다는 것이다.