검찰이 윤갑근 전 대구고검장이 건설업자 윤중천씨와의 유착 의혹을 발표한 법무부 검찰 과거사위원회와 대검 진상조사단 관계자들을 명예훼손 혐의로 고소한 사건과 관련해 박관천 전 청와대 공직기강비서관실 행정관을 불러 조사했다.
과거사위는 윤 전 고검장이 2013년 '김학의 사건' 1차 수사 당시 서울중앙지검 차장검사로서 특수강간 고소사건, 무고사건의 최종 결재자였고, 2014년 2차 수사 당시엔 대검찰청 강력부장으로 수사담당 부서인 서울중앙지검 강력부를 지휘한 사실에 주목해 이같은 결과를 발표했다.
그러나 윤 전 고검장은 과거사위 발표 다음 날 "윤씨와 통화한 적도 없고 만난 적도 없다"며 정한중 검찰과거사위원장 대행과 김학의 전 차관 사건 주심위원인 김용민 변호사, 대검 진상조사단에서 조사 실무를 맡은 이규원 검사를 허위사실 유포에 따른 명예훼손 혐의로 서울중앙지검에 고소했다.